Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LMBRD1Q9NUN5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMBRD1Q9NUN5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms