Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms