Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms