Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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