Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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