Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCO2Q9BYV7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCO2Q9BYV7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms