Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIFKQ9BYG3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms