Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms