Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PI4K2AQ9BTU6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PI4K2AQ9BTU6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms