Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LPIN3Q9BQK8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms