Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEMA3CQ99985 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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