Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALPK3Q96L96 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALPK3Q96L96 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALPK3Q96L96 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALPK3Q96L96 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ALPK3Q96L96 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALPK3Q96L96 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms