Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERAC1Q96JX3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms