Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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RNF185Q96GF1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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RNF185Q96GF1 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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RNF185Q96GF1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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