Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHFRQ96EP1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms