Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C18orf8Q96DM3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms