Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHMTQ93088 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms