Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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