Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM46DQ8NEK8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms