Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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FAM71DQ8N9W8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FAM71DQ8N9W8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM71DQ8N9W8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM71DQ8N9W8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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FAM71DQ8N9W8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM71DQ8N9W8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM71DQ8N9W8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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