Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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