Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERC6Q8IVU3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms