Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CATSPER4Q7RTX7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms