Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL17Q6UXB2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CXCL17Q6UXB2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms