Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC19Q6DKK2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms