Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms