Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENND4CQ5VZ89 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms