Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RANBP3-202ENST00000340578 3233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CASP3-201ENST00000308394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 KLK2-201ENST00000325321 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AP003355.2-201ENST00000605923 2622 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms