Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZC2HC1CQ53FD0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms