Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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SP6Q3SY56 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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