Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KNOP1Q1ED39 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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