Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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