Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms