Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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