Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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COL19A1Q14993 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COL19A1Q14993 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms