Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms