Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTAN1Q13813 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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