Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCIRG1Q13488 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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