Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SRSF6Q13247 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SRSF6Q13247 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SRSF6Q13247 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SRSF6Q13247 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SRSF6Q13247 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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SRSF6Q13247 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SRSF6Q13247 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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