Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAF1AQ13111 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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