Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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