Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BNIP3Q12983 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms