Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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