Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TWF1Q12792 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWF1Q12792 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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