Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4DQ08499 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms