Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNDQ07001 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms