Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms