Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP7AQ04656 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms