Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSC2Q02487 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DSC2Q02487 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms