Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms